MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 9709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	CTA	3	9	1476	1484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020450	TAT	2	6	1489	1494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020450	TGTC	2	8	2712	2719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020450	T	6	6	2767	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020450	GATA	2	8	9705	9712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020450	TTAAAT	2	12	10490	10501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020450	GGT	2	6	10567	10572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020450	TGA	2	6	10618	10623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020450	TAAT	2	8	10731	10738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020450	AAATG	2	10	11885	11894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020450	AAG	2	6	11895	11900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020450	GAA	2	6	11945	11950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020450	A	6	6	11952	11957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020450	AAGG	2	8	11977	11984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020450	A	6	6	12395	12400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020450	AGG	2	6	12473	12478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020450	AAT	2	6	12481	12486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020450	GAT	2	6	12528	12533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020450	AATAA	2	10	12535	12544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020450	GAT	2	6	12569	12574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020450	A	7	7	12598	12604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020450	TA	3	6	12677	12682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020450	TAC	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020450	CAA	2	6	12782	12787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020450	ATTCT	2	10	12906	12915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020450	TA	3	6	12938	12943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020450	TAGA	2	8	14047	14054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020450	T	9	9	14089	14097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020450	CTC	2	6	14098	14103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020450	TAAA	2	8	14108	14115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020450	TAA	2	6	14123	14128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020450	AGA	2	6	14785	14790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020450	A	7	7	18864	18870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020450	TA	3	6	18893	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020450	A	6	6	18906	18911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020450	TAA	2	6	18919	18924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020450	A	6	6	18937	18942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020450	A	6	6	18952	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020450	A	7	7	19485	19491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020450	TAA	2	6	19516	19521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020450	ATG	2	6	19535	19540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020450	TTA	3	9	19546	19554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020450	TAAA	2	8	19555	19562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020450	CAAA	2	8	19571	19578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020450	ATC	2	6	19874	19879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020450	A	6	6	20610	20615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020450	TAT	2	6	20616	20621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020450	T	6	6	20626	20631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020450	CTATT	2	10	20638	20647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020450	ACA	2	6	20704	20709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020450	ATT	2	6	20713	20718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020450	AGA	3	9	23380	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020450	A	6	6	23443	23448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020450	TTC	2	6	23466	23471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020450	ATTG	2	8	23510	23517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020450	A	6	6	23929	23934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020450	TACT	2	8	23946	23953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020450	TTA	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020450	AAG	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020450	TAA	3	9	24058	24066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020450	T	9	9	26188	26196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020450	A	6	6	26232	26237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020450	GAC	2	6	26273	26278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020450	TTA	2	6	26287	26292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020450	ATT	2	6	26305	26310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020450	A	7	7	26340	26346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020450	ATA	2	6	26358	26363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020450	CAA	2	6	26387	26392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020450	CGG	2	6	26435	26440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020450	GGA	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020450	GCGT	2	8	26534	26541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020450	TCC	2	6	26558	26563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020450	AGC	2	6	26585	26590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020450	TCG	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020450	CGG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020450	CTTAA	2	10	26806	26815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020450	TATT	2	8	26903	26910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020450	AAGTC	2	10	26947	26956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020450	GTA	2	6	27038	27043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020450	ATG	2	6	27061	27066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020450	T	7	7	27117	27123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020450	ATC	2	6	27135	27140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020450	TTTA	2	8	27175	27182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020450	TTG	2	6	27188	27193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020450	A	6	6	29111	29116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020450	A	6	6	31545	31550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020450	T	6	6	31571	31576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020450	TA	3	6	31613	31618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020450	TAAA	2	8	31657	31664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020450	AGTA	2	8	31670	31677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020450	GA	3	6	32845	32850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020450	TGA	2	6	32851	32856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020450	T	6	6	32857	32862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020450	A	8	8	32905	32912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020450	GTT	2	6	33221	33226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020450	CATT	2	8	33231	33238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020450	AAT	2	6	33317	33322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020450	TTTG	2	8	33339	33346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020450	T	6	6	33410	33415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020450	TTA	2	6	33495	33500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020450	GTTGAC	2	12	33569	33580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020450	TGA	2	6	33592	33597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020450	TAG	2	6	33645	33650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020450	TGA	2	6	33664	33669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020450	ATTT	2	8	33684	33691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020450	A	6	6	33750	33755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020450	CTT	2	6	33805	33810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020450	A	6	6	33813	33818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020450	A	6	6	33835	33840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020450	A	6	6	33886	33891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020450	GTT	2	6	33892	33897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020450	AAC	2	6	33918	33923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020450	AAT	2	6	33928	33933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020450	TAAA	2	8	34269	34276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020450	A	6	6	34274	34279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020450	T	6	6	35940	35945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020450	AAT	2	6	35987	35992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020450	GAAAT	2	10	36003	36012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020450	A	6	6	36039	36044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020450	AAAT	2	8	36050	36057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020450	TTA	2	6	36058	36063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020450	AAT	2	6	36100	36105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020450	TTA	2	6	36116	36121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020450	ATA	2	6	36709	36714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020450	TAA	2	6	36747	36752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020450	TAC	2	6	36837	36842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020450	T	7	7	37013	37019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020450	AGTAA	2	10	37037	37046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020450	ATA	2	6	37065	37070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020450	AGA	2	6	38337	38342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020450	T	7	7	38354	38360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020450	AAATA	2	10	38370	38379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020450	A	6	6	39247	39252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020450	T	6	6	40988	40993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020450	AGAA	2	8	41005	41012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020450	TAA	2	6	41042	41047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020450	TAA	2	6	41083	41088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020450	TTA	2	6	41108	41113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020450	T	6	6	44873	44878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020450	A	8	8	46101	46108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020450	AAT	2	6	46985	46990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020450	AAG	2	6	47011	47016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020450	AAAT	2	8	47705	47712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020450	TAG	2	6	47775	47780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020450	TG	3	6	48848	48853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020450	ATT	2	6	48868	48873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020450	TAAA	2	8	48897	48904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020450	A	6	6	48902	48907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020450	A	7	7	48909	48915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_020450	T	7	7	55684	55690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_020450	TAT	2	6	122397	122402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_020450	AT	3	6	122482	122487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_020450	AAT	2	6	122541	122546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_020450	A	6	6	122575	122580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_020450	TA	4	8	122586	122593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_020450	TAAA	2	8	122596	122603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_020450	AG	3	6	122647	122652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020450	A	6	6	122683	122688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_020450	AGT	2	6	122692	122697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_020450	TCT	2	6	122713	122718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_020450	TCA	2	6	122752	122757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_020450	TAAA	2	8	122907	122914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_020450	AT	4	8	124449	124456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_020450	AAC	2	6	124459	124464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_020450	A	6	6	125205	125210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_020450	GGT	2	6	125259	125264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_020450	TAATT	2	10	128069	128078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_020450	ATT	2	6	130123	130128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_020450	CTTT	2	8	132082	132089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
493	NC_020450	A	6	6	132123	132128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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